依托所拥有的生物学、环境科学与工程2个博士后工作站，实验室常年接受有志于从事淡水生态学、渔业生物技术、水生生物资源利用与保护和水环境工程等方面研究的博士后研究人员。实验室鼓励博士后研究人员积极申报科研项目，重视博士后期间独立科研能力的培养。实验室以“为国家培养水生态环境保护和渔业可持续发展研究领域的骨干研究人才”为己任，欢迎基础扎实，学风严谨，吃苦耐劳，有团队合作精神，已获得博士学位的青年科技人员提出申请，优秀博士后有加入淡水生态与生物技术国家重点实验室相关研究团队的工作机会。2020年在站博士后51人。